International Commission for the Taxonomy of Fungi (ICTF)
International Union of Microbiological Societies (IUMS, Mycology Division)
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Phylogenetic (barcode) Markers Distribution

List of phylogenetic (barcode) markers used in oligonucleotide barcoding and similarity search.

Total Species: 101

Total sequences: 686 123 180 141  118  124
Species (total: 101) ITS1 and 2 tef1_int4(large) tef1_int5(short) tef1_exon6(large) rpb2_exon
01harz H. lixii/T. harzianumnote 21 26 6 3 2
02cer T. cerinumnote 1 5 1 1  
02tom T. tomentosumnote 1 9 2 1 1
03cinn H. cinnamomea/T. cinnamomeum 1 1 1 3 5
04stram H. straminea/T. stramineum 1 1 1 1 1
05vel T. velutinum 1 4 2    
06atrog H. atrogelatinosa 1     1 1
07cat H. catoptron/T. catoptron 1 1 1 1 1
09cfaur T. sp. DAOM 175924note 2 3 1    
100kons T. koningiopsis 2 4 1    
10aggrA T. aggressivum f. aggressivum 1 5 1 1 1
10aggrE T. aggressivum f. europaeum 1 2 1    
11tawa H. tawa/T. tawa 1 1 2 2 2
12thail H. thailandica/T. thailandicum 1 1 1 1 1
13cras H. crassa/T. crassumnote 1 1 2 2 3
13long T. longipilenote 1 1 1 1 1
14vir H. virens/T. virens 1 2 4   1
15hun H. hunua 1 1 2 1  
15sem H. semiorbis 2 1 1 1 1
17fert T. fertile 1 1 2 2 2
18obl T. oblongisporum 1 1 2 1 1
19aurM H. aureoviridis var. macrosporanote 1 1 1 1  
20stri H. strictipilosa/T. strictipilisnote 1 1 1 19 27
22cun H. cuneispora 1 1 1 1 1
23_3559 T. sp. PPRI 3559note 1 1 2    
24ross T. rossicum 1 3 6    
25strom T. stromaticum 2 1 1 1  
26brev T. brevicompactum 1 7 2 1 1
27lut H. luteanote 1 1 1 1 1
27melano H. melanomagnanote 1 1 1 1 1
29est H. estonica/T. estonicum 1 1 1 1 1
30ceram H. ceramica/T. ceramicum 1 1 1 1 1
31surr H. surrotunda/T. surrotundum 1 1 1 1 1
32sinu H. sinuosa/T. sinuosumnote 1 1 1 12 16
33crem H. cremea/T. cremeumnote 1 1 1 2 2
34chlo H. chlorospora/T. chlorosporum 1 1 1 3 5
35viresc H. virescentiflava 1 1 1 1 1
36cand H. candida/T. candidum 1 1 1 1 1
37cost H. costaricensis 1 1 1 1 1
38thele H. thelephoricola/T. thelephoricolum 1 1 1 1 1
39aure H. aureoviridis/T. aureoviride 1 1 1 2 2
40pilu H. pilulifera/T. piluliferum 1 1 2 1 1
41lacu H. lacuwombatensis 1 1 1    
42stel H. stellata 1 1 1    
43parap H. parapilulifera 1 1 1 1 1
44poly H. pachybasioides/T. polysporum 2 1 12 1 1
45minu H. minutispora/T. minutisporum 1 1 9 1 1
46citr H. citrina var. citrina 1 1 2 1 1
47sulph H. sulphurea 1     1  
48psy H. psychrophila 1     1 1
50pulv H. pulvinata 1     1 1
52hel T. helicum 2 3 4 1 2
53spir T. spirale 1 2 3 2 1
54gela H. gelatinosa/T. gelatinosum 1 1 2 3 3
55sulw H. sulawesensis 1 1 1 1 1
56nigrov H. nigrovirens 1 1 1 1 1
57chrom H. chromosperma/T. chromospermum 1 1 1 8 8
58phyll H. phyllostachydis/T. phyllostahydis 1 1 1 2 2
59kon T. koningiinote 1 2 2    
59oval T. ovalisporumnote 1 1      
60muri H. muroiananote 1        
62vir H. rufa/T. viridenote 1 7 1 3 1
63atro H. atroviridis/T. atroviride 1 5 2    
64erin T. erinaceum 1 1 4    
65strig T. strigosum 1 2 1 1 1
66stil H. stilbohypoxyli 1 3      
67ham T. hamatum 1 2 2 1 1
68pub T. pubescens   2 2 1 1
69asper T. asperellum 1 2 1    
70flav H. flaviconidia 1 3 1    
71neor H. neorufa 1 2      
72pez H. pezizoides 1     1 1
73andi H. andinensis 1 1 1    
74cereb H. cerebriformisnote          
74longib T. longibrachiatumnote 1 1 1   1
74orient H. orientalisnote 1 2 2 1  
76citri H. schweinitzii/T. citrinoviride 1 1 1   1
77pseud H. pseudokoningii/T. pseudokoningii 1 1 1    
78ghane T. ghanense 1 1 1    
79satur T. saturnisporum 1 1 1   1
80sin T. sinensis 1 2 4    
81jecor H. jecorina/T. reesei 1 1 1   1
82effu T. effusum 1 1 1    
83nov H. novaezelandiae 1 1 1    
84konil T. konilangbra 1   1    
86poron H. poronioidea          
88_3642 T. sp. MA 3642note 1   1    
91avel H. avellanea          
92rog T. rogersonii 1 1      
93aust T. austrokoningii   3      
94intr T. intricatum 1 2      
95taiw T. taiwanense 1 1      
96dorot T. dorotheae 1 1      
97ding T. dingleyaea 1 1      
98peter T. petersenii 1 3      
99a_caribbae T. caribbaeum var. aequatoriale 1 1      
99carib T. caribbaeum 1 2      
cryst H. crystalligena 1 1 1 1 1
pauci T. paucisporum 1 1 1    
theob T. theobromicola 1 1 1    
vogl H. voglmayrii 1 1 1 1 1

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